股权转让是企业与个人股东在资本运作中的常见环节，其中税务处理的合规性直接关系到交易成本与后续风险。针对近期咨询中的高频问题，万智团队结合最新税收政策，为您系统梳理个人股权转让的核心税务要点与操作实务。
01. 核心税务全景：
税种、纳税人与时点
一次个人股权转让，主要涉及两大税种，并由不同主体在特定时点履行义务。
涉及税种
- 个人所得税：税目为 “财产转让所得” ，这是股权转让中最主要的税负。
- 印花税：税目为 “产权转移书据” 。
纳税人是谁？何时申报？
- 个人所得税
纳税人：股权转让方（即出售股权的个人）。
扣缴义务人：股权受让方（无论是企业还是个人）。这是法定义务，若受让方未扣缴，转让方需自行申报。
申报时点：并非以工商变更为唯一标准，只要发生以下情形之一，均应在次月15日内申报纳税：
1.股权转让协议已生效；
2.受让方已支付（或部分支付）价款；
3.受让方已开始行使股东权利；
4.股权被司法或行政机关强制过户；
5.税务机关认定的其他股权已转移的情形。
- 印花税
纳税人：转让方和受让方双方均为纳税人，需各自缴纳。
02. 税款计算核心：
公式、税率与原值确认
个人所得税计算
应纳税额 = (股权转让收入 – 股权原值 – 合理费用) × 20%
- 股权转让收入：指转让方因股权转让而获得的各种形式的经济利益。
- 股权原值：即取得股权的成本。根据取得方式不同，确认原则如下：
1.现金出资：按实际支付价款及相关税费确认。
2.非货币资产出资：按投资时资产评估价及相关税费确认。
3.受赠或继承取得：符合条件的近亲属间转让，可按原持有人的原值加上本次税费确认。
4.转增股本：若用资本公积、盈余公积、未分配利润转增股本且已缴税，转增额可计入原值。
- 合理费用：指与本次转让直接相关的税费，如印花税、资产评估费、中介服务费等。
印花税计算
应纳税额 = 股权转让合同所载金额 × 0.05%（即万分之五）
- 政策现状：根据《中华人民共和国印花税法》自2022年7月1日起施行，产权转移书据印花税税率已法定为 0.05% ，与原暂行条例下的“股权转让书据”适用税率一致，政策连续有效。
03. 关键问题：
收入偏低、核定与特殊情形
税务机关对股权转让收入的真实性拥有核定权，这是实践中的高风险领域。
1. 何种情况被视为“收入明显偏低”？
申报价格符合以下情形之一，可能被认定为偏低：
- 低于对应的净资产份额（企业有土地、房产等资产的，需按公允价值计算）。
- 低于初始投资成本或取得股权所支付的价款。
- 低于相同或类似条件下同一企业或其他企业的股权转让价格。
- 不具有合理理由的无偿转让。
2.“收入偏低”的正当理由有哪些？
若因以下原因低价转让，并提供有效证明，可视为具有正当理由：
- 因国家政策调整导致企业生产经营受重大影响。
- 转让给配偶、父母、子女等特定近亲属，或具有抚养、赡养关系的抚养/赡养人。
- 根据企业章程规定的内部员工转让（不能对外转让的股权）。
- 其他能证明具有合理性的情形。
3. 税务机关如何核定收入？
税务机关将按以下顺序选择方法核定转让收入：
- 净资产核定法：最为常用，即参照股权对应的净资产份额或公允价值份额核定。
- 类比法：参照相同或类似条件下同一企业或同类企业的股权转让价格核定。
- 其他合理方法。
04. 实务操作要点与提示
针对咨询中的具体问题，万智结合实务经验提示如下：
1. 完税证明由谁办理？
纳税人（转让方）或扣缴义务人（受让方） 均可向被投资企业所在地的主管税务机关申请开具《自然人股东股权转让完税情况表》（或类似文书），作为工商变更登记的凭证。目前全国多地已推行 “先税后证” 的联动管理机制。
2. 转让价格与净资产的关系？
关系密切。在无特殊合理理由的情况下，税务机关最常采用“净资产核定法”来评判或核定转让收入是否公允。申报价格明显低于对应净资产份额的，是触发税务核定的首要信号。
3.“账面净资产额”如何填写？
在填报《个人股东股权转让情况表》时，“转让时企业账面净资产额”一般指股权转让协议生效日（或税务机关规定的时点）企业资产负债表上的所有者权益（净资产）总额。若企业资产中存在土地使用权、房产等公允价值显著高于账面价值的，需特别关注。
4. 股权转让与公司分红的关系？
这是两个完全独立的税务事项。股权转让是股东个人层面的财产转让行为，转让所得缴纳个人所得税后即完成纳税义务。无需、也不应该通过公司账上进行“分红”来处理。公司利润分配（分红）将另行产生个人所得税纳税义务，两者不可混淆。
5. 股权转让的税务合规风险提示
- 重视净资产评估：转让前，尤其对于拥有非货币性资产的公司，建议进行评估，作为确定公允价值的参考。
- 留存完整证据链：保留好出资凭证、转账记录、评估报告、相关协议等，以证明股权原值和交易真实性。
- 关注特殊政策：对于符合条件的小微企业、高新技术企业的股权转让，或特定园区政策，可能存在税收优惠，需提前筹划。
结语
个人股权转让的税务处理，核心在于准确确认 “收入-原值” ，并理解税务机关对交易公允性的审查逻辑。随着税收大数据监管的加强，工商、税务部门的协作日益紧密，合规申报已成为不可回避的前置环节。
我们建议，在进行股权转让前，务必进行税务影响的测算与合规性评估。对于结构复杂、涉及资产类型特殊或转让价格有特殊安排的交易，更应寻求专业机构的支持，以妥善管控税务风险，确保交易顺利完成。
希望这份指南能为您提供清晰的操作思路。关注万智，获取更前沿的财税政策解读与定制化的交易税务筹划方案，为您的资本运作保驾护航。
